微生物组分布于人类机体的许多器官中，这一肉眼看不见的群体，甚至决定了人类对营养的摄取以及抵御疾病的能力。因此，在过去几十年，了解微生物如何塑造人类健康和成长发育的研究极为热门。微生物究竟是在什么时候“定居”在人体内的？《自然》日前在线发表的来自英国剑桥大学一个团队的最新研究表明，健康的人类胎盘是没有微生物组的。这一结论被普遍认为是继年以来最大的一次反转。
婴儿首次接触微生物是在何时
怀孕后，人类胚胎开始形成一个重要的器官，那就是胎盘。胎盘既是胚胎的生命线又是监护者，会把母亲血液中的氧气、营养和免疫分子输送给发育中的胎儿，同时还是阻隔感染的屏障。1个多世纪以来，医生一直认为，像胎儿和子宫一样，胎盘也是没有微生物的，否则就是哪个地方出现了问题。而断奶后的婴儿拥有一个完整的微生物组，复杂程度与成人的相当。
美国得克萨斯州休斯敦贝勒医学院副教授谢斯蒂·奥高及同事年在《科学·转化医学》杂志上报告说，他们的研究表明，尽管并非每个胎盘都含有可检测到的细菌DNA，但很多胎盘中都有发现。
奥高等研究发现，婴儿出生时肠道内就有微生物群落存在，但与孕妇阴道中的微生物群落并不匹配，因此猜测新生儿肠道内的微生物群落存在其他来源，最有可能就是胎盘。
奥高等人还利用宏基因组鸟枪测序法，分析个来自捐赠的胎盘的微生物组成，发现胎盘中有大约种微生物存在，不过水平较低。为了获得这些微生物功能的深度图像，研究人员对样本的一个子集做了全基因组测序。在该子集大多数样本中，他们发现，胎盘中数量最多的是肠道中常见的、不致病的大肠杆菌，两种口腔菌坦纳氏普雷沃氏菌、奈瑟菌的数量也相对较多。当他们将胎盘中的微生物DNA与在身体其他部位常见的进行比较时，结果发现与口腔微生物种类最为吻合。
奥高猜测，口腔微生物可能首先“溜”入孕妇血液中，然后迁徙到胎盘中“定居”。研究还发现，早产胎儿与足月产胎儿的胎盘微生物群落组成存在明显不同，这可能说明胎盘微生物群落与早产之间存在关联。
健康胎盘中到底有没有微生物
其实，奥高等人的研究一经发表，就引发了巨大争议。一些研究人员认为，胎盘微生物的痕迹是“研究中使用的DNA提取工具包上的污染物”。美国宾夕法尼亚大学佩雷尔曼学院的研究团队在无菌纱布、试剂、DNA净化包和其他日常使用的设备上找到了微量DNA痕迹，而他们最终从6个胎盘样本中提取的细菌DNA与其在提取样本工具包上发现的DNA无法相互区分。同样，在剑桥大学研究团队看来，年的研究是有缺陷的，他们的研究表明，之前研究认为胎盘中存在的细菌来源于实验室污染，以及分娩过程中的转移。
剑桥大学的研究团队分析了来自名女性的胎盘样本，是经阴道分娩或通过剖腹产分娩得到的,既有健康的孕妇也有不怎么健康的孕妇，这是迄今为止用于此类研究最大数量的样本。
剑桥团队用人体中未发现的细菌，即沙门氏菌来刺激组织，作为阳性对照，然后提取DNA。其中80个样本，研究人员使用了16SrRNA基因测序和宏基因组分析。宏基因组又称元基因组或生态基因组，是指与人类共生的全部微生物的基因总和。也就是说，16SrRNA测序是针对所有细菌保守的基因部分，宏基因组分析则是测出样品中微生物遗传物质的所有序列，然后对应到特定菌种。
对于其余样品，研究人员并行使用两种不同的DNA提取试剂盒，然后对每种样品进行16S测序，比较两种试剂盒的结果。
该研究发现了多种微生物的存在？其实不然，用不同的试剂盒和试剂批次测序时，研究人员找不到始终存在的微生物物种。比如阴道乳杆菌，在顺产的孕妇胎盘样本中存在，但剖宫产的不存在，这说明这些微生物是在分娩时附着在胎盘上，而不是在分娩前就生活在胎盘里的，分娩过程中的感染才是微生物的来源。同理，研究发现胎盘中存在的一些与阴道炎症有关的微生物，也是在分娩过程中“得到”的。
除了分娩时从外界获得，微生物还可能来自胎盘的处理过程，研究人员收集胎盘是在盐溶液中洗涤再冷冻的，整个过程同样也有微生物污染。再就是来自于提取DNA的过程，甚至是来自于测序仪。在对不同实验时间、操作人员、试剂批次和测序仪都进行记录，研究人员确定这些微生物污染不是来自于不同时间、人和设备之间的差异，而是普遍存在的。这也证实了以前的报告：DNA提取试剂盒中存在相对丰富的微生物群；同时意味着，胎盘中所谓的微生物组其实都来自于分娩后。
在剑桥大学的研究中，无乳链球菌是胎盘中唯一可以发现的细菌，在5%的样本中发现了它的存在，而且并非来自环境污染。无乳链球菌是一种致病菌，可能导致新生儿败血症、肺炎和脑膜炎，它的存在意味着胎盘在孕妇体内时发生了感染。也就是说，除非发生了感染，胎盘应该是无菌的。而在正常生理条件下，婴儿从胎盘中获得微生物的可能性极小。
论文作者之一、剑桥大学的生殖生物学家查诺克·琼斯说：“总的来说，结果表明健康胎盘中没有微生物，除非它被感染了。”
人体微生物组